Protein Model on 6l7o_F_1_TB_1 (TEMPLATE: 6l7o )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FF 1 (F) polymer(polypeptide(L)) [647 aa] NADH dehydrogenase subunit 5 :Q8DKX9_THEEB
2 b TB 1 (F) non-polymer(AJP) Digitonin 244F 293T 296W 300F
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:6l7o_F_1
6l7o_F_1       1:MEPLYQYAWLIPVLPLLGALIVGFGLIAFSETTSKLRRPSAIFIMALMAIAMGHSLTLFWSQVQGHLPYTQMIEWAAAGNLHIAMGYVIDPLAALMLVIV: 100
SecStr          : HHHHHT SSTTTHHHHHHHHHHHHHTTTSSHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE S  SS   EEEEEE HHHHHHHHHH:    
ExpBur          :eeeebeebeebbeebeebbeebeebeeeeeeebeeeeeebbeebbebbeebbeebeebeeebeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeebebbbeebbbbbbbbb:    

6l7o_F_1     101:TTVAFLVMLYSDGYMAHDPGYVRFFAYLSLFGSSMLGLVVSPNLVQVYIFWELVGMCSYLLIGFWYDRKSAAEAAQKAFVTNRVGDFGLLLGMVGLFWAT: 200
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHTSS S  HHHHHHHHHHHHHHHHHHS  SHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SS  SSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :    
ExpBur          :bebbbbbbbbbbebbeeeeebbebbbebbebbbbbbbbbbbbbbbbbbeebeebbebbeebbebeeeeeeeeebbebbeebbeebbebbeebbebbeeeb:    

6l7o_F_1     201:GTFDFAGMGDRLTELVNTGLLSPSLAAILAILVFLGPVAKSAQFPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGVFLIARMFPVFEQLPQVMTTIAWTGAF: 300
SecStr          :S   HHHHHHHHHHHHHTTSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHS  SSS THHHHHHSS HHHHHHHHHTTSHHHHHHHHHTTHHHHSS HHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :eebebebbbeebeebeeeeeeeeeebbeebeebbebbbbbbbbeebbbbbbebbeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbeebeebbeebbebbbe:    
Contact         :                                           b                                                b  b   b

6l7o_F_1     301:TAFMGATIAITQNDIKKSLAYSTISQLGYMVMGMGVGAYSAGLFHLMTHAYFKAMLFLGSGSVIHSMEGVVGHNPDLAQDMRYMGGLRKYMPITGATFLV: 400
SecStr          :HHHHHHHHSSS   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS S HHHHS STT    TTT HHHHHHHHH:    
ExpBur          :bbebbbebbebbeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeebbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbebebbeeeebbebbebbbbbeeebeebbebbee:    

6l7o_F_1     401:GCLAISGVPPFAGFWSKDEILGAVFHANPAMWLLTWLTAGLTAFYMFRMYFMTFEGKFRNVPPERQEHHDHHSHHAAVPHESPWTMTLPLVVLAIPSTLI: 500
SecStr          :HHHHHH SSS HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSS      TTS     SSS   SS    SSTTHHHHHHTTHHHHHH:    
ExpBur          :bbebbebeeeebbbbbbbebbbbbeeeeeebbeebeebbbebbbbbbbbbbbbbeeeeeebeeeeeeeeeeeeeebeebeebeebbbebbeebeeebeeb:    

6l7o_F_1     501:GFVGTPFNNLFEVFIHAPGXXXXXXXXXDLTEFLILGGSSVGIGLMGITVAYLMYLKGTPSPQAIAKAIQPLYQFSLHKWYFDELYEAVFIKGCRRLARQ: 600
SecStr          :HHHT TTT HHHHHS    ---------  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTT SS HHHHHHH SHHHHHHHSSSS HHHHTHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :beebbeeeeebeeebeeee---------eeeeeeebbeebeebbeebeeebeebeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeebeeeeebeeeeeeeeeeeeeeeeee:    

6l7o_F_1     601:VLEVDYNVVDGVVNLTGFVTMVTGEGLKYLQNGRAQFYALIVLLAVLGFVIFSVQT--------------------------------------------: 656
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-:    
ExpBur          :eeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123