Protein Model on 5cnt_D_1_AA_1 (TEMPLATE: 5cnt )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FD 1 (D) polymer(polypeptide(L)) [733 aa] Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha :RIR1_ECOLI
2 b AA 1 (D) non-polymer(UDP) URIDINE-5'-DIPHOSPHATE 208P 209T 224S 225C 252A 253G 294Q 298R 437N 438L 439C 441E 464L 620M 621P 622S 623E 624T 625S
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:5cnt_D_1
5cnt_D_1       1:XXXNLLVTKRDGSTERINLDKIHRVLDWAAEGLHNVSISQVELRSHIQFYDGIKTSDIHETIIKAAADLISRDAPDYQYLAARLAIFHLRKKAYGQFEPP: 100
SecStr          :---  EEE TTS EEE  THHHHHHHHHHTTT SS  HHHHHHHHT    TTEEHHHHHHHHHHHHHTT  SS TTHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSS  :    
ExpBur          :---eeebeeeeeeeeeeeeeebeeebeebbeebeeeebeebeeebeeeeeeebeeeebbeebbebbbebbeeebbbbbebbbebbbbbbbeeebeeeebe:    

5cnt_D_1     101:ALYDHVVKMVEMGKYDNHLLEDYTEEEFKQMDTFIDHDRDMTFSYAAVKQLEGKYLVQNRVTGEIYESAQFLYILVAACLFSNYPRETRLQYVKRFYDAV: 200
SecStr          : HHHHHHHHHHTTSS THHHHHS HHHHHHHHTT  GGGGGG  HHHHHHHHHHTS B TTT  B   HHHHHHHHHHHHTTTS TTTHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebeebbeebbeeeebbebbeeebeeebbeebeebbebeebeebbbbbbbbbbbbbbbbeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbebeeeebbebbeebbebb:    

5cnt_D_1     201:STFKISLPTPIMSGVRTPTRQFSSCVLIECGDSLDSINATSSAIVKYVSQRAGIGINAGRIRALGSPIRGGEAFHTGCIPFYKHFQTAVKSCSQGGVRGG: 300
SecStr          :HTTSEE  HHHHHHTTSSS    SEEEEE  SSHHHHHHHHHHHHHHHTTS EEEEE TTS  TT EETTTTEE   SHHHHHHHHHHHHTSEETTTEE :    
ExpBur          :bebebbbbbbbbbbbbbeebbbbebbbbbbbeeeebbebbbebbeebbeebbbbbbbbbbbebeebeeeeeeeebebbbeebeebbebbeeeebeebeeb:    
Contact         :       bb              bb                          bb                                        b   b  

5cnt_D_1     301:AATLFYPMWHLEVESLLVLKNNRGVEGNRVRHMDYGVQINKLMYTRLLKGEDITLFSPSDVPGLYDAFFADQEEFERLYTKYEKDDSIRKQRVKAVELFS: 400
SecStr          : EEEEEETTBTTHHHHTTSS SSS GGG  TTSEEEEEE HHHHHHHHTT EEEEE GGGSTTHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH SSS EEEEEHHHHHH:    
ExpBur          :ebbbbbbbbbbbbeebbbbbbeeeeeeebbeebbbbbbbbebbbebbeeeeebbbbbbeebeebbebbbeeeeebeebbeebbeeeebebeebebeebbe:    

5cnt_D_1     401:LMMQERASTGRIYIQNVDHCNTHSPFDPAIAPVRQSNLCLEIALPTKPLNDVNDENGEIALCTLSAFNLGAINNLDELEELAILAVRALDALLDYQDYPI: 500
SecStr          :HHHHHHHHHS EEEEETTHHHHTSSB TTTS B    SSS    B B  SSTT SS B EEEEEEEEETTT SSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS  SS:    
ExpBur          :bbbebbeeebebbbbbbbbbbebbbbeeeebbbbbbbbbbbbbbbbeebeeeebeebbbbbbbbbbbbbbebeebeebeebbebbbbbbbbbbebbebeb:    
Contact         :                                    bbb b                      b                                    

5cnt_D_1     501:PAAKRGAMGRRTLGIGVINFAYYLAKHGKRYSDGSANNLTHKTFEAIQYYLLKASNELAKEQGACPWFNETTYAKGILPIDTYKKDLDTIANEPLHYDWE: 600
SecStr          :HHHHHHHHHH  EEEEEE HHHHHHHTT  STTSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   TTGGGBTTTTT  HHHHS GGGGGT      S HH:    
ExpBur          :ebbeebbebbbbbbbbbbbbbbbbbeeeeebeeeebbebbbebbbbbbbbbbebbbebbeeeeebebbebbbbeebebbbeebeeebeebbeeeeebebe:    

5cnt_D_1     601:ALRESIKTHGLRNSTLSALMPSETSSQISNATNGIEPPRGYVSIKASKDGILRQVVPDYEHLHDAYELLWEMPGNDGYLQLVGIMQKFIDQSISANTNYD: 700
SecStr          :HHHHHHHHH  SSS  B B   TTGGGGGT   TTS  SSSEEEEE SSSEEEEE TTHHHHTTT   GGG S SHHHHHHHHHHHTT SS B   EEE :    
ExpBur          :ebbebbeeebbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbebbebebebeeeebebbbbebeebeeebbbbbebeebebbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbb:    
Contact         :                   bbbbbb                                                                           

5cnt_D_1     701:PSRFPSGKVPMQQLLKDLLTAYKFGVKTLYYQNTRD----------------------------------------------------------------: 736
SecStr          :GGGSGGG   HHHHHHHHHHHHHTT  EE  EEE -:    
ExpBur          :eeeeeeeeeeeeebbebbebbbebbbbbbbbbeee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123