Protein Model on 5cns_D_1_X_1 (TEMPLATE: 5cns )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FD 1 (D) polymer(polypeptide(L)) [734 aa] Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha :RIR1_ECOLI
2 b X 1 (D) non-polymer(CDP) CYTIDINE-5'-DIPHOSPHATE 208P 209T 224S 225C 253G 294Q 298R 437N 438L 439C 441E 464L 620M 621P 622S 623E 624T 625S
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:5cns_D_1
5cns_D_1       1:XXXNLLVTKRDGSTERINLDKIHRVLDWAAEGLHNVSISQVELRSHIQFYDGIKTSDIHETIIKAAADLISRDAPDYQYLAARLAIFHLRKKAYGQFEPP: 100
SecStr          :---  EEE TTS EEE  HHHHHHHHHHHTTT SS  HHHHHHHTT    TTEEHHHHHHHHHHHHHHT  SS TTHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSS  :    
ExpBur          :---eeebeeeeeeeeeeeeeebeebbeebbeebeeeebeebeeebeeeeeeebeeeebbeebbebbbeebeeebbbbbebbbebbbbbbbeebbeeeebe:    

5cns_D_1     101:ALYDHVVKMVEMGKYDNHLLEDYTEEEFKQMDTFIDHDRDMTFSYAAVKQLEGKYLVQNRVTGEIYESAQFLYILVAACLFSNYPRETRLQYVKRFYDAV: 200
SecStr          : HHHHHHHHHHTTSS THHHHHS HHHHHHHHTT  GGGGGG  HHHHHHHHHTTS B TTT  B   HHHHHHHHHHHHTTTS TTTHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebeebbeebbeeeebbebbeeebeeebbeebeebbebeebeebbbbbbbbbbbbbbbbeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbebeeeebbebbeebbebb:    

5cns_D_1     201:STFKISLPTPIMSGVRTPTRQFSSCVLIECGDSLDSINATSSAIVKYVSQRAGIGINAGRIRALGSPIRGGEAFHTGCIPFYKHFQTAVKSCSQGGVRGG: 300
SecStr          :HTTSEE  HHHHHHTTSSS    SEEEEE  SSHHHHHHHHHHHHHHHTTT EEEEE TTS  TT EETTTTEE   SHHHHHHHHHHHHTSEETTTEE :    
ExpBur          :bebebbbbbbbbbbbbbeebbbbbbbbbbbbeeeebbebbbebbeebbeebbbbbbbbbbbebeebeeeeeeeebebbbeebeebbebbeeeebeebeeb:    
Contact         :       bb              bb                           b                                        b   b  

5cns_D_1     301:AATLFYPMWHLEVESLLVLKNNRGVEGNRVRHMDYGVQINKLMYTRLLKGEDITLFSPSDVPGLYDAFFADQEEFERLYTKYEKDDSIRKQRVKAVELFS: 400
SecStr          : EEEEEETTBTTHHHHTTSSSS S GGG  TTSEEEEEE HHHHHHHHTT EEEEE TTSSTTHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH SSS EEEEEHHHHHH:    
ExpBur          :ebbbbbbbbbbbbeebbbbbbeeeeeeebbeebbbbbbbbebbbebbeeeeebbbbbbeebeebbebbbeeeeebeebbeebbeeeebeeeebebeebbe:    

5cns_D_1     401:LMMQERASTGRIYIQNVDHCNTHSPFDPAIAPVRQSNLCLEIALPTKPLNDVNDENGEIALCTLSAFNLGAINNLDELEELAILAVRALDALLDYQDYPI: 500
SecStr          :HHHHHHHHHS EEEEETTHHHHTSSB TTTS      SSS      B  SSTT SS B EEEEEEEEETTS SSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS  SS:    
ExpBur          :bbbebbeeebebbbbbbbbbbebbbbeeeebbbbbbbbbbbbbbbbeebeeeebeebbbbbbbbbbbbbbbbeebeebeebbebbbbbbbbbbebbebeb:    
Contact         :                                    bbb b                      b                                    

5cns_D_1     501:PAAKRGAMGRRTLGIGVINFAYYLAKHGKRYSDGSANNLTHKTFEAIQYYLLKASNELAKEQGACPWFNETTYAKGILPIDTYKKDLDTIANEPLHYDWE: 600
SecStr          :HHHHHHHHHH  EEEEEE HHHHHHHTT  SSSSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   TTGGGBTTTTT  HHHHS GGGGGT      S HH:    
ExpBur          :ebbeebbebbbbbbbbbbbbbbbbbeeeeebeeeebbebbbebbbbbbbbbbebbbebbeeeeebebbebbbbeebebbbeebeeebeebbeeeeeeebe:    

5cns_D_1     601:ALRESIKTHGLRNSTLSALMPSETSSQISNATNGIEPPRGYVSIKASKDGILRQVVPDYEHLHDAYELLWEMPGNDGYLQLVGIMQKFIDQSISANTNYD: 700
SecStr          :HHHHHHHHH  S S  B B   TTGGGTTT   TT   SSSEEEE  SSS EEEE TTHHHHTTT   GGG S SHHHHHHHHHHHTT SS B   EEE :    
ExpBur          :ebbebbeeebbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbebbebebebeeeebebbbbebeebeebbbbbbebeebebbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbb:    
Contact         :                   bbbbbb                                                                           

5cns_D_1     701:PSRFPSGKVPMQQLLKDLLTAYKFGVKTLYYQNTRDG---------------------------------------------------------------: 737
SecStr          :GGGSGGG   HHHHHHHHHHHHHTT  EE  EEE  -:    
ExpBur          :eeebeeeeeeeeebbebbebbbebbbbbbbbbeeee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123