HOMCOS:化合物に対する結合タンパク質の検索

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入力した化合物と類似した化合物群と複合体を形成しているタンパク質のリストを作成します。相互作用する可能性のあるタンパク質や、モデリング可能な化合物とタンパク質のペアを知ることができます。

調べたい化合物は、(1)PDBの３文字表記の入力,(2)SMILES文字列を入力、(3)化合物のファイル(SDF, MOL, MOL2, PDB)のアップロード、の３つの方法で入力することができます。
PDBの３文字の化合物コード: HSM, ATP, ALE, CAU, G39...
KEGG compound/drug の化合物コード: C00388, C00002, D00095, D07608, D01977...
SMILES文字列: CNCC(c1ccc(c(c1)O)O)O
化合物ファイルのアップロード:
SDF MOL MOL2 PDB
JSMEエディタで問い合わせ化合物を描く:

KCOMBU検索の設定

あるPDB３文字コードの化合物と複合体を作るタンパク質のリストを作成する。化学構造検索は行いません。
PDBの３文字の化合物コード: ALE, ATP, CAU, G39...

化学構造検索にはKCOMBUを用いています。
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